Λογισμικό για επιστημονική χρήση
Κατηγορία
Compilers (Μεταγλωττιστές)
| Όνομα |
Διαθέσιμες εκδόσεις |
|---|---|
| GNU Compiler Collection (GCC) | 3.4.6 και 4.4.7 |
| Intel C/C++ and Fortran Compiler Suite | 14.0.1.106 (Licensed per user) |
| Pathscale (Ekopath) Compiler Suite | 3.1 και 4.0.10 |
| Open64 Compiler Suite | 4.5.2 |
| Cuda Toolkit | 6.0 |
Υπολογιστικές και I/O Βιβλιοθήκες
Όνομα |
Διαθέσιμες εκδόσεις |
|---|---|
| BLAS | 3.2.1 |
| LAPACK | 1.7.5, 3.2.1 |
| ATLAS | 3.8.4 |
| ARPACK | 3.1.3 |
| ScaLAPACK | 1.7.5 |
| BLACS | 1.1 |
| Intel MKL Libraries | 11.1 |
| GNU Scientific Library (GSL) | 1.13 |
| Boost C++ | |
| HDF5 | 1.8.5 |
| NetCDF | 4.1.1, 4.3.1 |
| FFTW3 | 3.2.1 |
| Grib | 1.12.1 |
| Jasper | 1.900.1 |
| PnetCDF | 1.7.0,1.8.0 |
| igraph | 0.5.3 |
| Geant4 Toolkit | 9.4.p01 |
| Numpy | 1.4.1, 1.9.2, 1.12.0 |
| Scipy | 0.7.2, 0.18.1 |
| Cython | 0.23.4 |
| Matplotlib | 15.1, 2.0.0 |
| VLFeat | 0.9.20 |
| GDAL | 1.7.3 |
| SPAMS (SPArse Modeling Software) | |
| Basemap | |
| TeX Live |
MPI Wrappers
Όνομα |
Διαθέσιμες εκδόσεις |
|---|---|
| Mpich3 | 3.1.1 |
| Mpich2 | 1.2.1 |
| OpenMPI | 1.5.4 |
Εφαρμογές
Όνομα |
Κατηγορία |
Σχόλια |
|---|---|---|
| WRF | Earth Sciences | |
| UPP | Earth Sciences | |
| CAMx | Earth Sciences | |
| RegCM | Earth Sciences | |
| Chimere | Earth Sciences | |
| Chimplot | Earth Sciences | |
| Ferret | Earth Sciences | |
| FLOW-3D | CFD | Licensed per user |
| NUMECA | CFD | Licensed per user |
| ANSYS/Fluent | CFD | Licensed (μέσω ΚΗΔ) |
| ANSYS/CFX | CFD | Licensed (μέσω ΚΗΔ) |
| Code_Saturne | CFD | |
| OpenFOAM | CFD | |
| Sphysics | CFD | |
| ANSYS | CFD | Licensed (μέσω ΚΗΔ) |
| Lumerical/FDTD | CAD | Licensed per user |
| Code_Aster | Engineering | |
| NAMD | Chemistry/Materials | |
| CP2K | Chemistry/Materials | |
| LAMMPS | Chemistry/Materials | |
| VASP | Chemistry/Materials | Licensed per user |
| Gaussian | Chemistry/Materials | Licensed per user |
| Abinit | Chemistry/Materials | |
| Quantum Espresso | Chemistry/Materials | |
| DL_POLY | Chemistry/Materials | |
| Siesta | Chemistry/Materials | |
| VESTA | Visualization for Electronic and STructural Analysis | |
| Corsika | Physics | |
| ANSYS Electromagnetics (HFSS) | Engineering/Physics | Licensed (μέσω ΚΗΔ) |
| hfss-matlab API | Engineering/Physics | |
| MsVar | Life Sciences | |
| ecoPCR | Life Sciences | |
| ecoPrimers | Life Sciences | |
| STACKS | Life Sciences | |
| EIGENSOFT | Life Sciences | |
| ADMIXTURE | Life Sciences | |
| STRUCTURE | Life Sciences | |
| fastStructure | Life Sciences | |
| FastQC | Life Sciences | |
| FASTX-Toolkit | Life Sciences | |
| Trim_galore | Life Sciences | |
| Cutadapt | Life Sciences | |
| TopHat | Life Sciences | |
| SAMtools | Life Sciences | |
| bcftools | Life Sciences | |
| Picard | Life Sciences | |
| ANNOVAR | Life Sciences | |
| REDItools | Life Sciences | |
| VarScan | Life Sciences | |
| SRA Toolkit | Life Sciences | |
| OBITools | Life Sciences | |
| BEAST | Life Sciences | |
| PAML | Life Sciences | |
| RAxML / RAxML-HPC | Life Sciences | |
| PhyML | Life Sciences | |
| BLAST+ | Life Sciences | |
| dDocent | Life Sciences | |
| IGV | Life Sciences | |
| BEDTools | Life Sciences | |
| VCFTools | Life Sciences | |
| SeqMule | Life Sciences |
Καμία λίστα από τις παραπάνω δεν είναι περιοριστική. Εφόσον υπάρχει η ανάγκη να εγκατασταθούν επιπλέον εργαλεία ή να υποστηριχθούν επιπλέον εφαρμογές αυτό μπορεί να γίνει σε συννενόηση με την ομάδα του Γραφείου Επιστημονικών Υπολογιστικών Υπηρεσιών, ΚΗΔ ΑΠΘ μέσω των συνδέσμων αίτησης προσθήκης λογισμικού και αίτησης για υποστήριξη εφαρμογών.